Total War: Shogun 2 - Zmierzch Samurajów oddaje do dyspozycji graczy nową kampanię fabularną, przedstawiającą wydarzenia rozgrywające się cztery wieki po okresie Sengoku i traktującą o konflikcie pomiędzy zwolennikami cesarza, a ostatnim szogunatem. Po stronie szogunatu stają Aizu, Nagaoka, Jozai, natomiast cesarstwo reprezentują Choshu, Satsuma i Tosa (wszystkie rody są grywalne).
